Япония, начало XVII века. Английский штурман Джон Блэкторн терпит крушение и попадает в закрытую для европейцев Страну восходящего солнца, где проходит путь от пленника на грани жизни и смерти до правой руки борющегося за власть самурая Торанаги.
Действие разворачивается в двух временных линиях. В одной астронавт Джо Эрикссон терпит бедствие на Международной космической станции. В результате аварии система жизнеобеспечения и одна из спасательных капсул оказываются повреждены, и Джо нужно в одиночку, отправив свою команду на Землю, починить капсулу и вернуться самой. В другом временном периоде оправляющаяся от пережитой трагедии Джо уже воссоединилась с семьей, но обнаруживает, что часть ее воспоминаний о родных и привычной жизни как будто искажены, а часть фрагментов жизни и вовсе пропала...